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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Equipe AgroImpact de l'UMRT BioEcoAgro

Etude d’allèles à effet majeur sur la tolérance au froid du maïs

Identifier les différences de séquence génétique à l’origine de ces allèles pour sélectionner efficacement les versions les plus favorables.

Dans le cadre du WP6 du projet AMAIZING, nous avons construit des lignées de maïs quasi-isogéniques pour des régions chromosomiques ayant un fort impact sur la tolérance au froid. Afin d’aider à la sélection autour de ces zones, nous cherchons à affiner la position du polymorphisme de séquence à l’origine des différences de tolérance observées. Cela passe par l’étude de populations de grande taille (environ 2000 individus), issues de plantes hétérozygotes (=portant les deux allèles) dans la région considérée mais homozygotes (=portant un même allèle) pour le reste du génome. Compte-tenu de leur effectifs, ces populations sont phénotypées en serre froide. A ce jour, alors que le génome de maïs comprendrait plus de 30 000 gènes, nous avons réduit nos intervalles cibles à une centaine de gènes chacun.

Parallèlement, grâce à l’appui de nos partenaires (UGSF à Lille, CRRBM à Amiens, IJPB à Versailles, plateforme POPS à Orsay), nous étudions l’expression des gènes et des protéines pour différentes paires de lignées portant des allèles contrastés. Ce travail nous aidera à cibler les gènes candidats les plus probables dans nos zones d’intérêt.

Plus le polymorphisme causal sera localisé précisément, plus il sera facile d’identifier les meilleurs allèles dans la diversité génétique existante et de les suivre au moyen de marqueurs moléculaires dans les programmes de sélection.